fix:sample/plate 之前的开发

docs/dev/03-genotyping/03-reference_set.md

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+# 03 Genotyping - reference_set 表录入说明
+
+来源：`docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md`
+
+## 录入目标
+
+`reference_set` 表示参考基因组集合，是 reference、variantset、variant 的参考侧上游。它可以关联来源 germplasm。
+
+## 上下游关系
+
+| 类型 | 内容 |
+| --- | --- |
+| 表 | `reference_set` |
+| Java 实体 | `ReferenceSetEntity` |
+| 前置依赖 | 可选 `germplasm` |
+| 下游引用 | `reference`、`variantset`、`variant` |
+| API | `/brapi/v2/referencesets` |
+
+## 字段录入
+
+| 字段 | 业务意义 | 录入方式 | 校验规则 |
+| --- | --- | --- | --- |
+| `id` | reference set 主键 | 系统生成；导入时可指定 | 必填、唯一 |
+| `auth_user_id` | 数据所属用户 | 登录上下文自动写入 | 不允许前端手填 |
+| `reference_set_name` | 参考集合名称 | 用户录入 | 建议必填 |
+| `assemblypui` | assembly 永久标识 | 用户录入/导入 | 可选，建议唯一 |
+| `description` | 参考集合说明 | 多行文本 | 可选 |
+| `is_derived` | 是否派生参考 | 开关 | 可选 |
+| `md5checksum` | 校验值 | 文本 | 可选，格式提示 |
+| `sourceuri` | 来源 URI | URL 输入 | 可选，URL 格式校验 |
+| `species_ontology_term` | 物种本体 term | 文本/本体选择器 | 可选 |
+| `species_ontology_termuri` | 物种本体 URI | URL 输入 | 可选，URL 格式校验 |
+| `source_germplasm_id` | 来源 germplasm | Germplasm 选择器 | 可选，若填需存在 |
+
+## 页面与交互
+
+- 列表页展示 referenceSetName、assemblyPUI、species、sourceGermplasm、reference 数、variantset 数。
+- 详情页展示 reference、variantset、variant 入口。
+
+## 关键校验
+
+1. 删除 reference_set 前检查 `reference`、`variantset`、`variant` 引用。
+2. 若填写 `source_germplasm_id`，必须引用已存在 germplasm。
+3. md5 checksum 建议做格式提示，不强行阻断历史数据。