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brapi-java/docs/dev/03-genotyping/08-callset.md
2026-05-28 16:53:53 +08:00

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Raw Permalink Blame History

03 Genotyping - callset 表录入说明

来源:docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md

录入目标

callset 表示某个 sample 的一组 genotype calls通常对应一个样本在一个或多个 variantset 上的调用集合。

上下游关系

类型 内容
callset
Java 实体 CallSetEntity
前置依赖 sample
下游引用 allele_callcallset_variant_sets
API /brapi/v2/callsets

字段录入

字段 业务意义 录入方式 校验规则
id callset 主键 系统生成;导入时可指定 必填、唯一
auth_user_id 数据所属用户 登录上下文自动写入 不允许前端手填
call_set_name 调用集合名称 用户录入/导入 建议必填,同一 sample 下建议唯一
sample_id 所属 sample Sample 选择器/导入 必选,必须存在
created 创建时间 系统写入/导入 可选
updated 更新时间 系统写入/导入 可选

页面与交互

  • CallSet 列表页支持按 sample、variantSet、callSetName 查询。
  • 从 Sample 详情创建时默认带出 sample_id
  • 需要通过 callset_variant_sets 绑定参与的 variantset。

关键校验

  1. sample_id 必须存在。
  2. 删除 callset 前检查 allele_callcallset_variant_sets
  3. 如果 callset 绑定多个 variantset查询和导出时要明确当前 variantset 范围。

状态:已完成