Files
brapi-java/docs/dev/03-genotyping/06-variantset.md
2026-05-28 15:51:39 +08:00

1.9 KiB
Raw Blame History

03 Genotyping - variantset 表录入说明

来源:docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md

录入目标

variantset 表示一批 variant 的集合通常对应一次测序、芯片、DArTSeq 或某个 study 下的位点集合。

上下游关系

类型 内容
variantset
Java 实体 VariantSetEntity
前置依赖 reference_setstudy
下游引用 variantcallset_variant_setsvariantset_analysisvariantset_format
API /brapi/v2/variantsets

字段录入

字段 业务意义 录入方式 校验规则
id variantset 主键 系统生成;导入时可指定 必填、唯一
auth_user_id 数据所属用户 登录上下文自动写入 不允许前端手填
variant_set_name 变异集合名称 用户录入/导入 建议必填
reference_set_id 参考基因组集合 ReferenceSet 选择器 建议必选,若填需存在
study_id 所属 study Study 选择器 可选,若填需存在

页面与交互

  • VariantSet 列表页支持按 referenceSet、study、variantSetName 查询。
  • 详情页展示 variants、callsets、analysis、available formats。
  • 从 Study 工作台创建时默认带出 study_id
  • 本版本不做:单条删除、批量删除;放到下一版本实现。

关键校验

  1. reference_set_id 与下属 variant.reference_set_id 应保持一致。
  2. 导入大型 variantset 时建议先建 variantset再异步导入 variants 和 calls。
  3. 下一版本再做:删除 variantset 前检查 variantcallset_variant_setsvariantset_analysisvariantset_format(含单条删除与批量删除)。

开发状态

已完成2026-05-28列表查询、新增、编辑、详情。

下一版本:单条删除、批量删除。