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03 Genotyping - genome_map 表录入说明
来源:docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md
录入目标
genome_map 表示遗传图谱,用于组织 linkage group,并通过 marker_position 将 variant 放到图谱坐标上。
上下游关系
| 类型 | 内容 |
|---|---|
| 表 | genome_map |
| Java 实体 | GenomeMapEntity |
| 前置依赖 | crop,可关联 study |
| 下游引用 | linkageGroup / linkage_group |
| API | /brapi/v2/maps |
字段录入
| 字段 | 业务意义 | 录入方式 | 校验规则 |
|---|---|---|---|
id |
map 主键 | 系统生成;导入时可指定 | 必填、唯一 |
auth_user_id |
数据所属用户 | 登录上下文自动写入 | 不允许前端手填 |
map_name |
图谱名称 | 用户录入 | 建议必填 |
mappui |
map 永久标识 | 用户录入/导入 | 可选,建议唯一 |
crop_id |
所属作物 | Crop 选择器 | 可选,若填需存在 |
scientific_name |
学名 | 文本 | 可选 |
type |
图谱类型 | 下拉/文本 | 可选 |
unit |
图谱单位,如 cM | 文本/下拉 | 可选 |
published_date |
发表日期 | 日期选择器 | 可选 |
documentationurl |
文档链接 | URL 输入 | 可选,URL 格式校验 |
comments |
备注 | 多行文本 | 可选 |
页面与交互
- GenomeMap 列表页支持按 crop、mapName、type 查询。
- 详情页展示 linkage groups 和 marker positions。
- 可通过图谱详情批量导入 linkage group 与 marker position。
关键校验
- 删除 genome_map 前检查 linkage group 引用。
- 若关联 study,应检查 study 的 crop 与 map 的 crop 一致。
unit应与 marker_position 的 position 语义保持一致。