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03 Genotyping - variantset 表录入说明
来源:docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md
录入目标
variantset 表示一批 variant 的集合,通常对应一次测序、芯片、DArTSeq 或某个 study 下的位点集合。
上下游关系
| 类型 | 内容 |
|---|---|
| 表 | variantset |
| Java 实体 | VariantSetEntity |
| 前置依赖 | reference_set、study |
| 下游引用 | variant、callset_variant_sets、variantset_analysis、variantset_format |
| API | /brapi/v2/variantsets |
字段录入
| 字段 | 业务意义 | 录入方式 | 校验规则 |
|---|---|---|---|
id |
variantset 主键 | 系统生成;导入时可指定 | 必填、唯一 |
auth_user_id |
数据所属用户 | 登录上下文自动写入 | 不允许前端手填 |
variant_set_name |
变异集合名称 | 用户录入/导入 | 建议必填 |
reference_set_id |
参考基因组集合 | ReferenceSet 选择器 | 建议必选,若填需存在 |
study_id |
所属 study | Study 选择器 | 可选,若填需存在 |
页面与交互
- VariantSet 列表页支持按 referenceSet、study、variantSetName 查询。
- 详情页展示 variants、callsets、analysis、available formats。
- 从 Study 工作台创建时默认带出
study_id。
关键校验
reference_set_id与下属variant.reference_set_id应保持一致。- 删除 variantset 前检查
variant、callset_variant_sets、variantset_analysis、variantset_format。 - 导入大型 variantset 时建议先建 variantset,再异步导入 variants 和 calls。