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03 Genotyping - callset 表录入说明
来源:docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md
录入目标
callset 表示某个 sample 的一组 genotype calls,通常对应一个样本在一个或多个 variantset 上的调用集合。
上下游关系
| 类型 | 内容 |
|---|---|
| 表 | callset |
| Java 实体 | CallSetEntity |
| 前置依赖 | sample |
| 下游引用 | allele_call、callset_variant_sets |
| API | /brapi/v2/callsets |
字段录入
| 字段 | 业务意义 | 录入方式 | 校验规则 |
|---|---|---|---|
id |
callset 主键 | 系统生成;导入时可指定 | 必填、唯一 |
auth_user_id |
数据所属用户 | 登录上下文自动写入 | 不允许前端手填 |
call_set_name |
调用集合名称 | 用户录入/导入 | 建议必填,同一 sample 下建议唯一 |
sample_id |
所属 sample | Sample 选择器/导入 | 必选,必须存在 |
created |
创建时间 | 系统写入/导入 | 可选 |
updated |
更新时间 | 系统写入/导入 | 可选 |
页面与交互
- CallSet 列表页支持按 sample、variantSet、callSetName 查询。
- 从 Sample 详情创建时默认带出
sample_id。 - 需要通过
callset_variant_sets绑定参与的 variantset。
关键校验
sample_id必须存在。- 删除 callset 前检查
allele_call和callset_variant_sets。 - 如果 callset 绑定多个 variantset,查询和导出时要明确当前 variantset 范围。