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brapi-java/docs/dev/04-germplasm/02-germplasm.md
2026-05-28 11:56:17 +08:00

3.5 KiB
Raw Blame History

04 Germplasm / Seed - germplasm 表录入说明

来源:docs/architecture/04-germplasm-seed-data-flow.md

录入目标

germplasm 是种质主表,保存 accession、PUI、分类、采集、来源、育种方法和展示名称等身份信息。它不是库存批次库存批次由 seed_lot 表达。

上下游关系

类型 内容
germplasm
Java 实体 GermplasmEntity
前置依赖 crop,可选 breeding_method
下游引用 germplasm_attribute_valuegermplasm_donorgermplasm_institutegermplasm_origingermplasm_synonymgermplasm_taxonpedigree_nodecross_parentseed_lot_content_mixture
API /brapi/v2/germplasm

字段录入

字段 业务意义 录入方式 校验规则
id germplasm 主键 系统生成;导入可指定 必填、唯一
auth_user_id 数据所属用户 登录上下文自动写入 不允许前端手填
germplasm_name 种质名称 用户录入/导入 建议必填
default_display_name 默认展示名称 用户录入/自动生成 可选,缺省用 germplasm_name
germplasmpui 种质永久标识 用户录入/导入 可选,建议唯一
accession_number accession 编号 用户录入/导入 可选,建议唯一
crop_id 所属作物 Crop 选择器 建议必选,若填需存在
breeding_method_id 育种方法 BreedingMethod 选择器 可选,若填需存在
genus 用户录入 可选
species 用户录入 可选
species_authority 种命名人 用户录入 可选
subtaxa 亚种/变种 用户录入 可选
subtaxa_authority 亚种命名人 用户录入 可选
country_of_origin_code 来源国家代码 国家选择器 可选
collection collection 用户录入 可选
acquisition_date 获取日期 日期选择器 可选
acquisition_source_code 获取来源编码 枚举选择 可选
biological_status_of_accession_code 生物状态编码 枚举选择 可选
mls_status MLS 状态 枚举选择 可选
germplasm_preprocessing 种质预处理说明 文本 可选
seed_source 种子来源描述字段 文本 可选,不等于 seed_lot
seed_source_description 种子来源补充说明 多行文本 可选
documentationurl 文档链接 URL 输入 可选URL 格式校验

附属信息

附属表 内容
germplasm_donor donor accession、donor institute
germplasm_institute host、donor、breeding、collecting、redundant 等机构
germplasm_origin 来源坐标和坐标不确定性
germplasm_synonym 别名及别名类型
germplasm_taxon taxon 来源和值
germplasm_entity_type_of_germplasm_storage_code storage type code 列表

页面与交互

  • Germplasm 列表页支持按 crop、germplasmName、accessionNumber、PUI、synonym 查询。
  • 详情页以 Tab 展示 attributes、donors、institutes、origin、synonyms、taxon、pedigree、seed lots、cross parent 记录。
  • 从 Study/ObservationUnit 或 SeedLot 进入时应能回到 germplasm 详情。

关键校验

  1. germplasm_name 建议必填,accession_numbergermplasmpui 建议唯一。
  2. 删除 germplasm 前必须检查属性值、seed lot 组成、cross parent、pedigree、sample/taxon 等引用。
  3. 不要用 seed_source 表达库存;库存必须走 seed_lot