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# 03 Genotyping - allele_call 表录入说明
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来源:`docs/architecture/03-genotyping-data-flow.md`
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## 录入目标
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`allele_call` 是最终 genotype 调用结果。业务上它就是 Call:一条记录表示某个 sample/callset 在某个 variant 上的 genotype、read depth、likelihood 等结果。
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## 上下游关系
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| 类型 | 内容 |
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| 表 | `allele_call` |
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| Java 实体 | `CallEntity` |
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| 前置依赖 | `callset`、`variant` |
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| 下游引用 | 无 |
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| API | `/brapi/v2/calls` |
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## 字段录入
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| 字段 | 业务意义 | 录入方式 | 校验规则 |
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| `id` | call 主键 | 系统生成;导入时可指定 | 必填、唯一 |
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| `auth_user_id` | 数据所属用户 | 登录上下文自动写入 | 不允许前端手填 |
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| `call_set_id` | 所属 callset | CallSet 选择器/导入 | 必选,必须存在 |
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| `variant_id` | 对应 variant | Variant 选择器/导入 | 必选,必须存在 |
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| `genotype` | genotype 值,如 0/1、A/T | 文本/导入 | 建议必填 |
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| `read_depth` | 测序深度 | 数字输入/导入 | 可选,非负 |
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| `genotype_likelihood` | genotype likelihood | 数字输入/导入 | 可选 |
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| `phase_set` | phase set | 文本/导入 | 可选 |
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## 页面与交互
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- 通常不做逐条手工录入,主要通过 VCF/HapMap/矩阵文件导入。
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- 列表页支持按 callset、sample、variantset、variant 查询。
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- 在 Variant 详情页可查看该位点下的 calls,在 Sample/CallSet 详情页可查看该样本的 calls。
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## 关键校验
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1. `call_set_id` 和 `variant_id` 必须存在。
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2. 同一 callset 对同一 variant 不应重复。
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3. `allele_call` 不应直接承担 variant 定义字段;位点信息应来自 `variant`。
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